坐落在円山公园北边、清廉院南方的知恩院是日本净土宗的总本山,占地相当广阔,绕行一圈大约就需半小时以上。西元1175年(承安5年),净土宗开山大师法然上人以此為佈教据点,先在此地建立了大谷禪房,而后其弟子源智上人就在法然居住过的地方兴建了御影堂,知恩院的雏型才告确立。
广大的知恩院依山势分為下中上三部分,最底下是巨大的三门、塔头以及学校;中段则是御影堂、集会堂和大小方丈,是知恩院的主体所在;最上方山坡上则分布著势至堂、庙堂、濡髮祠等建筑。其中三门和御影堂被列為国宝,而重要文化财更包括唐门、经藏、大方丈、小方丈、势至堂等,可以说整座寺院就是一个日本佛教建筑的珍宝。
除了拥有庞大的建筑佳构,包括世界上最大木造大门的三门之外,知恩院还有些奇特的现象,一般人称之為「七不思议」,是吸引游人的一大卖点,其中较知名的包括一把藏身屋簷樑木间的雨伞、一隻放在室内廊下屋樑上的巨大的木汤匙、地板会发出声响的长廊、画在屏风上一隻眼睛似乎会随人移动焦点的猫……等。
知恩院还奉祀著和中国的月下老人一样的濡髮童子,他背负著替天下有情人牵红线的任务,传说中的濡髮童子其实是是白狐仙,最喜欢替人媒介情色,因此知恩院又有结缘寺的别称。每年除夕,知恩院内一座要17个和尚才能撞得响的大鐘,则经常透过电视转播向全国民眾传递旧去新来的讯息。